首款高密度SNP芯片助力茶树研究

某茶树遗传育种团队基于龙井43基因组参考序列与茶树重测序数据，开发出一款200K茶树SNP芯片。该芯片是茶树领域首个高密度SNP芯片，选用“龙井43”（雌性）与“白毫早”（雄性）F1材料，能够将18226个SNP位点绘入图谱，获得5325个Bin-Marker，连锁图谱总长为2107.01厘摩，相邻标记的平均遗传图距为0.39厘摩，构建了目前遗传密度最高的连锁图谱。

实验验证表明，该芯片能有效定位关键QTL位点，并用于发掘茶树的关键功能基因。对不同茶树品种的SNP分型研究显示，大叶种与小叶种之间存在两处强选择位点，为揭示品质调控相关基因以及两变种之间的进化关系提供了重要线索。

该研究为茶树高密度遗传图谱及相关性状改良研究提供了有力工具。